176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1564 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  100 
 
 
686 aa  1407    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  76.17 
 
 
986 aa  1092    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  68.52 
 
 
992 aa  973    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  87.06 
 
 
992 aa  1243    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  77.19 
 
 
986 aa  1108    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  69.68 
 
 
1004 aa  1000    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  78.39 
 
 
986 aa  1125    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  37.05 
 
 
1017 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  37.37 
 
 
984 aa  363  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  38.08 
 
 
981 aa  351  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  39.02 
 
 
1008 aa  351  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  37.33 
 
 
1003 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  34.53 
 
 
1097 aa  301  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  31.27 
 
 
1056 aa  234  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  31.83 
 
 
1096 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  31.62 
 
 
1055 aa  225  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.86 
 
 
1617 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  27.04 
 
 
1651 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  26.84 
 
 
1685 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.43 
 
 
1550 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.48 
 
 
1617 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  25.38 
 
 
1642 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  26.31 
 
 
1638 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.13 
 
 
1618 aa  99.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  26.31 
 
 
1638 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.3 
 
 
1642 aa  99  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  26.33 
 
 
1609 aa  98.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.83 
 
 
1614 aa  97.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 
1590 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.55 
 
 
1613 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  26.26 
 
 
1601 aa  97.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  26.44 
 
 
1685 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  25.25 
 
 
1611 aa  96.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  25.68 
 
 
1613 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  27.16 
 
 
1122 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  24.58 
 
 
1617 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.6 
 
 
1585 aa  95.1  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1615 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 
1615 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  25.45 
 
 
1614 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  24.8 
 
 
1613 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 
1614 aa  94.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  26.7 
 
 
1594 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.84 
 
 
1613 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  24.86 
 
 
1614 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.16 
 
 
1643 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.19 
 
 
1586 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.73 
 
 
1583 aa  92  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  25.35 
 
 
1646 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.55 
 
 
1628 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  24.3 
 
 
1613 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25 
 
 
1616 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  25.7 
 
 
1625 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  25.82 
 
 
1656 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  25.98 
 
 
1595 aa  90.9  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  24.28 
 
 
1605 aa  91.3  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.49 
 
 
1625 aa  90.9  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.41 
 
 
1623 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 
1622 aa  90.5  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.33 
 
 
1612 aa  90.5  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  25.04 
 
 
1622 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.66 
 
 
1582 aa  89.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  24.46 
 
 
1613 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.05 
 
 
1584 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  22.06 
 
 
1119 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.55 
 
 
1613 aa  87.8  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  24.73 
 
 
1630 aa  87.8  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  25.24 
 
 
1610 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.09 
 
 
1634 aa  87.8  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  25.09 
 
 
1595 aa  86.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  23.52 
 
 
1591 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  21.9 
 
 
1119 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  24.05 
 
 
1614 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.92 
 
 
1620 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.92 
 
 
1620 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.71 
 
 
1613 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  24.18 
 
 
1653 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  24.09 
 
 
1613 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.09 
 
 
1613 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  24.09 
 
 
1613 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  25.23 
 
 
1625 aa  84.7  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  25.23 
 
 
1625 aa  84.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  24.57 
 
 
1627 aa  84.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.63 
 
 
1614 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.88 
 
 
1614 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.88 
 
 
1614 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  25.66 
 
 
1586 aa  83.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  23.94 
 
 
1626 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 
1614 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.71 
 
 
1614 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  23.94 
 
 
1619 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  23.91 
 
 
1621 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  24.4 
 
 
1590 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  23.81 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  23.97 
 
 
1674 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  23.81 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  23.24 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  23.32 
 
 
1614 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  23.81 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.13 
 
 
1639 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>