More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1382 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.28 
 
 		 981 aa  945    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  100 
 
 		 984 aa  2028    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  56.71 
 
 		 1017 aa  1154    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  61.12 
 
 		 1008 aa  1183    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  38.4 
 
 		 1003 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  36.48 
 
 		 1097 aa  525  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.65 
 
 		 992 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  34.28 
 
 		 986 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  34.94 
 
 		 1004 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.04 
 
 		 992 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.99 
 
 		 986 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  34.6 
 
 		 986 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  37.37 
 
 		 686 aa  363  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  33.28 
 
 		 1056 aa  297  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  33.78 
 
 		 1055 aa  276  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  28.57 
 
 		 1096 aa  274  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.53 
 
 		 1685 aa  119  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  24.75 
 
 		 1685 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.56 
 
 		 1639 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  26.43 
 
 		 1651 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.14 
 
 		 1617 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.68 
 
 		 1634 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.99 
 
 		 1613 aa  108  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  24.83 
 
 		 1617 aa  107  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  27.18 
 
 		 1613 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  25.42 
 
 		 1625 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.93 
 
 		 1628 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  28.04 
 
 		 1643 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  26.31 
 
 		 1622 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  24.54 
 
 		 1590 aa  103  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1586 aa  103  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  27.77 
 
 		 1626 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  25.29 
 
 		 1614 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  25.75 
 
 		 1605 aa  102  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  26.57 
 
 		 1674 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  24.48 
 
 		 1614 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  24.48 
 
 		 1614 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1614 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  27.04 
 
 		 1613 aa  101  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.89 
 
 		 1613 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.63 
 
 		 1614 aa  101  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  26.8 
 
 		 1613 aa  101  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1614 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.33 
 
 		 1612 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  27.11 
 
 		 1614 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1119 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1613 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1613 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 		 1613 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.71 
 
 		 1585 aa  99.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1119 aa  99  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  24.74 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  24.82 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  25.32 
 
 		 1404 aa  98.6  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  22.86 
 
 		 1619 aa  98.2  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  27.21 
 
 		 1627 aa  98.2  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  26.65 
 
 		 1590 aa  97.8  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.34 
 
 		 1550 aa  97.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  22.86 
 
 		 1626 aa  97.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.27 
 
 		 1617 aa  97.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  24.28 
 
 		 1663 aa  97.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02008  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.92 
 
 		 1511 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  24.28 
 
 		 1663 aa  97.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  25.98 
 
 		 1583 aa  96.3  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  26.35 
 
 		 1656 aa  96.3  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  23.46 
 
 		 1602 aa  95.5  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.81 
 
 		 1630 aa  95.1  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  26 
 
 		 1613 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1574 aa  94.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 		 1638 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 		 1638 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.65 
 
 		 1582 aa  93.2  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.54 
 
 		 1613 aa  93.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.52 
 
 		 1625 aa  93.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.07 
 
 		 1609 aa  93.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1613 aa  92.8  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  24.52 
 
 		 1614 aa  92.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  23.91 
 
 		 1658 aa  92  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2027  NAD-glutamate dehydrogenase  25.6 
 
 		 1578 aa  91.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  23.71 
 
 		 1615 aa  91.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  23.55 
 
 		 1595 aa  91.3  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  23.87 
 
 		 1615 aa  91.3  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.27 
 
 		 1628 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1600 aa  90.5  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1614 aa  90.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  28.21 
 
 		 1653 aa  90.5  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.82 
 
 		 1614 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1600 aa  90.5  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  25.61 
 
 		 1663 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1122 aa  90.1  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  25.82 
 
 		 1621 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.5 
 
 		 1618 aa  90.1  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.12 
 
 		 1614 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.12 
 
 		 1614 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  25.68 
 
 		 1622 aa  90.1  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.61 
 
 		 1621 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.61 
 
 		 1627 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  23.85 
 
 		 1614 aa  89.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  25.41 
 
 		 1621 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.97 
 
 		 1614 aa  89  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>