228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45239 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  100 
 
 
1097 aa  2280    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.31 
 
 
1003 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.25 
 
 
1017 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  36.48 
 
 
984 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  36.35 
 
 
1008 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.13 
 
 
981 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.54 
 
 
992 aa  311  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  29.85 
 
 
1004 aa  311  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  29.83 
 
 
992 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  34.53 
 
 
686 aa  301  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  36.32 
 
 
1055 aa  300  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  35.8 
 
 
1096 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  31.08 
 
 
1056 aa  291  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.07 
 
 
986 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  32.91 
 
 
986 aa  283  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  32.34 
 
 
986 aa  282  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  24.88 
 
 
1622 aa  91.3  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  26.72 
 
 
1591 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  26.21 
 
 
1591 aa  79.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  24.79 
 
 
1595 aa  79  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  27.47 
 
 
1621 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  25.97 
 
 
1600 aa  78.2  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  25.97 
 
 
1600 aa  78.2  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  27.55 
 
 
985 aa  77.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0586845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  25.72 
 
 
1618 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.88 
 
 
1590 aa  76.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  26.12 
 
 
1601 aa  76.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  27.69 
 
 
1663 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  26.67 
 
 
1651 aa  75.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  27.69 
 
 
1621 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.33 
 
 
1586 aa  75.5  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  25.94 
 
 
1602 aa  75.1  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  25.34 
 
 
1618 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.77 
 
 
1613 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  27.55 
 
 
1621 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.3 
 
 
1582 aa  73.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  24.57 
 
 
1619 aa  73.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  28.95 
 
 
1617 aa  72.8  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.85 
 
 
1628 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  24.57 
 
 
1626 aa  72.8  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0272  NAD-glutamate dehydrogenase  26.34 
 
 
1518 aa  72  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.32 
 
 
1612 aa  72  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 
1585 aa  72  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  25.71 
 
 
1611 aa  71.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2027  NAD-glutamate dehydrogenase  24.82 
 
 
1578 aa  71.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  23.18 
 
 
1610 aa  69.7  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.36 
 
 
1643 aa  68.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  25.94 
 
 
1614 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  25.82 
 
 
1653 aa  68.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.3 
 
 
1583 aa  68.2  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  23.86 
 
 
1674 aa  68.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.71 
 
 
1614 aa  67.4  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  23.89 
 
 
1614 aa  67.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.83 
 
 
1617 aa  66.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  24.62 
 
 
1612 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  25.24 
 
 
1595 aa  65.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18860  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.84 
 
 
1621 aa  65.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  26.74 
 
 
1569 aa  65.5  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  27.98 
 
 
1614 aa  65.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02008  NAD-specific glutamate dehydrogenase  27.11 
 
 
1511 aa  64.7  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  26.79 
 
 
1613 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  26.65 
 
 
1613 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1819  NAD-glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 
1641 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  unclonable  0.000181151  decreased coverage  0.00683073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  26.9 
 
 
1638 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  26.9 
 
 
1638 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  26.49 
 
 
1613 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  26.49 
 
 
1613 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  24.34 
 
 
1404 aa  63.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  26.49 
 
 
1613 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  26.49 
 
 
1613 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  27.31 
 
 
1630 aa  63.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  25.15 
 
 
1625 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  25.15 
 
 
1625 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.89 
 
 
1634 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.93 
 
 
1613 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  26.03 
 
 
1627 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  26.78 
 
 
1627 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  26.2 
 
 
1609 aa  62.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.27 
 
 
1625 aa  62.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  27.99 
 
 
1642 aa  62.4  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.49 
 
 
1613 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1620 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.57 
 
 
1623 aa  62  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  26.04 
 
 
1646 aa  62  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  27.09 
 
 
1614 aa  62  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.66 
 
 
1613 aa  62  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08360  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  25.45 
 
 
459 aa  61.6  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0598327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  26.19 
 
 
1622 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.07 
 
 
1616 aa  61.6  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.14 
 
 
1621 aa  61.6  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  27.76 
 
 
1625 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  26.44 
 
 
1623 aa  61.6  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  27.46 
 
 
1119 aa  61.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  25.36 
 
 
1614 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.12 
 
 
1619 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.12 
 
 
1619 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  26.16 
 
 
1626 aa  60.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.12 
 
 
1619 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  26.87 
 
 
1119 aa  60.1  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  24.21 
 
 
1586 aa  60.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>