150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1724 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  48.7 
 
 		 1663 aa  730    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  48.64 
 
 		 1663 aa  729    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  48.47 
 
 		 1663 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  51.54 
 
 		 1638 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1574 aa  664    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  44.99 
 
 		 1550 aa  720    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  44.93 
 
 		 1621 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  46.39 
 
 		 1600 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  44.33 
 
 		 1614 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  47.67 
 
 		 1618 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  48.26 
 
 		 1119 aa  734    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1625 aa  746    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  45.15 
 
 		 1119 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  43.18 
 
 		 1625 aa  745    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  53.23 
 
 		 1614 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  47.31 
 
 		 1618 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.63 
 
 		 1619 aa  710    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  51.09 
 
 		 1617 aa  766    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  52.56 
 
 		 1613 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.29 
 
 		 1582 aa  680    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  47.85 
 
 		 1622 aa  729    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.1 
 
 		 1628 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  50.95 
 
 		 1634 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  54.79 
 
 		 1613 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  52.17 
 
 		 1613 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  47.36 
 
 		 1614 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.98 
 
 		 1625 aa  730    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0211  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.76 
 
 		 1573 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  40.27 
 
 		 1586 aa  641    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  40.71 
 
 		 1583 aa  666    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  47.42 
 
 		 1590 aa  743    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.5 
 
 		 1627 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.89 
 
 		 1628 aa  753    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  54.53 
 
 		 1613 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  46.34 
 
 		 1614 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.97 
 
 		 1612 aa  761    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  46.76 
 
 		 1619 aa  717    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  54.77 
 
 		 1623 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  47.57 
 
 		 1572 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  53.1 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.06 
 
 		 1619 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.18 
 
 		 1618 aa  767    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  43.71 
 
 		 1612 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.73 
 
 		 1586 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.1 
 
 		 1614 aa  731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.1 
 
 		 1614 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.54 
 
 		 1616 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  45.9 
 
 		 1615 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.67 
 
 		 1642 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  52.85 
 
 		 1613 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  48.59 
 
 		 1620 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.75 
 
 		 1617 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  53.1 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  54.13 
 
 		 1613 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.99 
 
 		 1614 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  55.03 
 
 		 1584 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.31 
 
 		 1639 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  46.22 
 
 		 1613 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.06 
 
 		 1619 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  42.21 
 
 		 1595 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  49.1 
 
 		 1627 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  43.86 
 
 		 1626 aa  727    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  52.25 
 
 		 1614 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  48.93 
 
 		 1585 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  45.77 
 
 		 1569 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  52.73 
 
 		 1610 aa  694    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  52.85 
 
 		 1613 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  44.32 
 
 		 1614 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  50.12 
 
 		 1619 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  47.36 
 
 		 1614 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  49.15 
 
 		 1623 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  50.66 
 
 		 1685 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  46.83 
 
 		 1614 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.39 
 
 		 1613 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  47.07 
 
 		 1382 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  53.1 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  52.23 
 
 		 1615 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  48.65 
 
 		 1674 aa  747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  47.02 
 
 		 1600 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.19 
 
 		 1553 aa  666    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  48.34 
 
 		 1621 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  47.1 
 
 		 1625 aa  730    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  50.18 
 
 		 1624 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  48.2 
 
 		 1595 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  44.79 
 
 		 1605 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  48.59 
 
 		 1620 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  51.7 
 
 		 1653 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  44.32 
 
 		 1614 aa  735    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  46.51 
 
 		 1602 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  54.81 
 
 		 1611 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  45.02 
 
 		 1626 aa  717    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  46.81 
 
 		 1618 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  47.23 
 
 		 1614 aa  729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  45.55 
 
 		 1614 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  51.26 
 
 		 1685 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  44.32 
 
 		 1614 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  52.28 
 
 		 1622 aa  760    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  45.14 
 
 		 1619 aa  719    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  48.34 
 
 		 1621 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  49.15 
 
 		 1615 aa  716    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>