150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3605 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  43.06 
 
 		 1614 aa  1126    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  42.64 
 
 		 1613 aa  1090    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  44.16 
 
 		 1663 aa  1255    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1122 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  36.38 
 
 		 1574 aa  1020    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  38.33 
 
 		 1550 aa  1061    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  44.37 
 
 		 1621 aa  1291    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1600 aa  1122    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  45.76 
 
 		 1614 aa  1370    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  43.71 
 
 		 1618 aa  1250    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  43.94 
 
 		 1119 aa  967    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  45.02 
 
 		 1625 aa  1402    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  43.88 
 
 		 1119 aa  964    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  45.14 
 
 		 1625 aa  1402    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  44.48 
 
 		 1614 aa  1318    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  43.78 
 
 		 1618 aa  1248    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.87 
 
 		 1619 aa  1169    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.94 
 
 		 1617 aa  1525    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.4 
 
 		 1613 aa  1407    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.44 
 
 		 1582 aa  978    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  33.04 
 
 		 1594 aa  779    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.57 
 
 		 1628 aa  1283    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1831  NAD-specific glutamate dehydrogenase  34.11 
 
 		 1598 aa  735    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.82 
 
 		 1613 aa  1409    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  43.92 
 
 		 1663 aa  1229    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  47.79 
 
 		 1613 aa  1411    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.91 
 
 		 1625 aa  1253    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0211  glutamate dehydrogenase (NAD)  39.22 
 
 		 1573 aa  908    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  35.17 
 
 		 1586 aa  957    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  33.15 
 
 		 1583 aa  966    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  43.83 
 
 		 1590 aa  1279    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.56 
 
 		 1627 aa  1179    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.11 
 
 		 1628 aa  1449    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.73 
 
 		 1613 aa  1407    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  44.76 
 
 		 1614 aa  1315    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.55 
 
 		 1612 aa  1322    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  41.9 
 
 		 1619 aa  1176    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.12 
 
 		 1623 aa  1435    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  39.59 
 
 		 1572 aa  911    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  47.92 
 
 		 1613 aa  1401    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.71 
 
 		 1619 aa  1282    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  51.93 
 
 		 1618 aa  1572    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  43.27 
 
 		 1612 aa  1273    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.37 
 
 		 1586 aa  1056    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.83 
 
 		 1614 aa  1369    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.83 
 
 		 1614 aa  1369    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.83 
 
 		 1616 aa  1402    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  44.27 
 
 		 1615 aa  1298    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.41 
 
 		 1642 aa  1138    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  47.73 
 
 		 1613 aa  1410    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  45.03 
 
 		 1620 aa  1271    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.63 
 
 		 1617 aa  1425    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  47.92 
 
 		 1613 aa  1401    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.89 
 
 		 1623 aa  758    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.63 
 
 		 1614 aa  1366    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.56 
 
 		 1584 aa  1396    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.52 
 
 		 1639 aa  1482    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1613 aa  1340    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.71 
 
 		 1619 aa  1282    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  39.18 
 
 		 1595 aa  1109    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  45.64 
 
 		 1627 aa  1281    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  42.29 
 
 		 1626 aa  1260    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  51.27 
 
 		 1622 aa  1531    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  45.56 
 
 		 1585 aa  1306    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  38.22 
 
 		 1569 aa  1050    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  45.65 
 
 		 1610 aa  1231    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  42.97 
 
 		 1615 aa  1111    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  45.18 
 
 		 1614 aa  1354    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.77 
 
 		 1619 aa  1283    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  45.3 
 
 		 1614 aa  1347    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  45.38 
 
 		 1623 aa  1256    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 1685 aa  3405    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  45.44 
 
 		 1614 aa  1355    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.59 
 
 		 1613 aa  1306    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1382 aa  1214    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  47.92 
 
 		 1613 aa  1401    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  48.23 
 
 		 1614 aa  1413    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  40.75 
 
 		 1586 aa  974    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  43.73 
 
 		 1600 aa  1123    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.71 
 
 		 1553 aa  928    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  44.04 
 
 		 1621 aa  1250    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  41.59 
 
 		 1625 aa  1212    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  44.93 
 
 		 1624 aa  1243    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  42.27 
 
 		 1595 aa  1113    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  43.4 
 
 		 1605 aa  1324    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  45.25 
 
 		 1620 aa  1277    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  50.58 
 
 		 1653 aa  1431    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  45.18 
 
 		 1614 aa  1355    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  43.35 
 
 		 1602 aa  1110    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  42.58 
 
 		 1611 aa  1071    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  44.13 
 
 		 1626 aa  1339    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  44.07 
 
 		 1618 aa  1340    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  44.9 
 
 		 1614 aa  1316    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  45.18 
 
 		 1614 aa  1312    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  94.96 
 
 		 1685 aa  3222    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  45.18 
 
 		 1614 aa  1354    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  47.73 
 
 		 1622 aa  1386    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.07 
 
 		 1619 aa  1339    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  44.27 
 
 		 1621 aa  1254    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  42.37 
 
 		 1615 aa  1088    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>