151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00479 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  45.07 
 
 		 1621 aa  1285    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  43.31 
 
 		 1614 aa  1328    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  45.13 
 
 		 1663 aa  1293    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1122 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1574 aa  969    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  38.75 
 
 		 1550 aa  1031    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  43.08 
 
 		 1621 aa  1270    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1600 aa  1103    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  43.63 
 
 		 1614 aa  1327    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  44.78 
 
 		 1618 aa  1278    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  45.25 
 
 		 1119 aa  990    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  43.92 
 
 		 1625 aa  1332    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  45.42 
 
 		 1119 aa  988    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  43.98 
 
 		 1625 aa  1333    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  41.95 
 
 		 1613 aa  1120    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  44.86 
 
 		 1618 aa  1278    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.98 
 
 		 1619 aa  1229    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.75 
 
 		 1617 aa  1267    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.99 
 
 		 1613 aa  1354    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 1582 aa  918    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  33.21 
 
 		 1594 aa  751    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.04 
 
 		 1628 aa  1309    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1831  NAD-specific glutamate dehydrogenase  34.29 
 
 		 1598 aa  744    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.27 
 
 		 1613 aa  1328    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  72.15 
 
 		 1663 aa  2425    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  45.89 
 
 		 1613 aa  1336    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.05 
 
 		 1625 aa  1311    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0211  glutamate dehydrogenase (NAD)  39.1 
 
 		 1573 aa  925    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  34.23 
 
 		 1586 aa  907    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  33.42 
 
 		 1583 aa  912    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  45.07 
 
 		 1590 aa  1304    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  41 
 
 		 1627 aa  1200    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.26 
 
 		 1628 aa  1379    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.77 
 
 		 1613 aa  1333    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  43.72 
 
 		 1614 aa  1326    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.48 
 
 		 1612 aa  1384    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  42.08 
 
 		 1619 aa  1230    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.32 
 
 		 1623 aa  1306    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  40.19 
 
 		 1572 aa  957    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  46.81 
 
 		 1613 aa  1338    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.1 
 
 		 1619 aa  1034    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.9 
 
 		 1618 aa  1358    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  42.11 
 
 		 1612 aa  1308    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.32 
 
 		 1586 aa  1085    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.79 
 
 		 1614 aa  1323    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.79 
 
 		 1614 aa  1323    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.4 
 
 		 1616 aa  1333    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  43.02 
 
 		 1615 aa  1296    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.64 
 
 		 1642 aa  1102    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  45.83 
 
 		 1613 aa  1335    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  45.22 
 
 		 1620 aa  1285    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.22 
 
 		 1617 aa  1211    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  46.81 
 
 		 1613 aa  1338    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.35 
 
 		 1623 aa  766    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.79 
 
 		 1614 aa  1323    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.28 
 
 		 1584 aa  1146    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.01 
 
 		 1639 aa  1307    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  43.98 
 
 		 1613 aa  1333    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.1 
 
 		 1619 aa  1034    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  39.34 
 
 		 1595 aa  1093    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  39.56 
 
 		 1627 aa  976    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  44.1 
 
 		 1626 aa  1291    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  42.28 
 
 		 1615 aa  1115    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  45.3 
 
 		 1585 aa  1328    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  37.84 
 
 		 1569 aa  997    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  42.52 
 
 		 1610 aa  1160    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  43.69 
 
 		 1614 aa  1167    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  44.1 
 
 		 1614 aa  1337    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.17 
 
 		 1619 aa  1036    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  43.74 
 
 		 1614 aa  1330    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  40.27 
 
 		 1623 aa  1018    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  45.48 
 
 		 1685 aa  1283    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  44.48 
 
 		 1614 aa  1350    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.62 
 
 		 1613 aa  1311    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  44.73 
 
 		 1382 aa  1194    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  46.81 
 
 		 1613 aa  1338    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  44.02 
 
 		 1622 aa  1243    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  48.19 
 
 		 1614 aa  1395    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  42.09 
 
 		 1586 aa  1057    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1600 aa  1105    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.25 
 
 		 1553 aa  958    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  45.01 
 
 		 1621 aa  1288    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  41.83 
 
 		 1625 aa  1221    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  39.93 
 
 		 1624 aa  1011    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  39.02 
 
 		 1595 aa  1041    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  43.7 
 
 		 1605 aa  1285    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  45.41 
 
 		 1620 aa  1284    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  42.97 
 
 		 1653 aa  1135    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  44.1 
 
 		 1614 aa  1338    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  41.72 
 
 		 1602 aa  1088    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  43.38 
 
 		 1611 aa  1110    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  43.27 
 
 		 1626 aa  1261    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  42.9 
 
 		 1618 aa  1325    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  43.7 
 
 		 1614 aa  1332    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  42.82 
 
 		 1614 aa  1286    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  45.26 
 
 		 1685 aa  1266    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  44.1 
 
 		 1614 aa  1338    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  46.29 
 
 		 1622 aa  1332    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.33 
 
 		 1619 aa  1266    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  45.07 
 
 		 1621 aa  1288    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>