149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1456 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  33.96 
 
 		 1614 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  32.79 
 
 		 1663 aa  735    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  31.75 
 
 		 1663 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1122 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1574 aa  697    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  31.11 
 
 		 1550 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  31.48 
 
 		 1621 aa  757    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1600 aa  713    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1614 aa  776    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1618 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1119 aa  705    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1625 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1119 aa  710    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1625 aa  767    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  34.01 
 
 		 1613 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  32.31 
 
 		 1618 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  31.95 
 
 		 1619 aa  764    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.51 
 
 		 1617 aa  792    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.21 
 
 		 1613 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  29.93 
 
 		 1582 aa  689    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  32.19 
 
 		 1594 aa  720    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.63 
 
 		 1628 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1831  NAD-specific glutamate dehydrogenase  31.92 
 
 		 1598 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.47 
 
 		 1613 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  34.98 
 
 		 1615 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  31.35 
 
 		 1622 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.6 
 
 		 1625 aa  771    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0211  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.24 
 
 		 1573 aa  719    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  29.68 
 
 		 1586 aa  658    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  29.33 
 
 		 1583 aa  677    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  32.08 
 
 		 1590 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  31.3 
 
 		 1627 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  31.66 
 
 		 1628 aa  747    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.86 
 
 		 1613 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  33.01 
 
 		 1614 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.88 
 
 		 1612 aa  820    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  32.09 
 
 		 1619 aa  767    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.26 
 
 		 1623 aa  789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  32.3 
 
 		 1572 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  33.65 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  30.94 
 
 		 1619 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  34.71 
 
 		 1618 aa  851    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  32.84 
 
 		 1612 aa  802    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.06 
 
 		 1586 aa  683    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.27 
 
 		 1614 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.27 
 
 		 1614 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 		 1616 aa  785    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  32.26 
 
 		 1615 aa  746    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  32.06 
 
 		 1642 aa  731    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  32.49 
 
 		 1613 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  32.02 
 
 		 1620 aa  725    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.04 
 
 		 1617 aa  780    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  33.65 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  100 
 
 		 1623 aa  3350    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 		 1614 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.64 
 
 		 1584 aa  720    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 		 1639 aa  749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1613 aa  760    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  30.94 
 
 		 1619 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  30.81 
 
 		 1595 aa  727    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  30.77 
 
 		 1627 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  32.88 
 
 		 1626 aa  776    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  33.65 
 
 		 1613 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  31.55 
 
 		 1585 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  31.02 
 
 		 1569 aa  674    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  33.79 
 
 		 1610 aa  757    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  32.5 
 
 		 1614 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  32.24 
 
 		 1614 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  30.94 
 
 		 1619 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  33.48 
 
 		 1614 aa  810    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  30.78 
 
 		 1623 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  32.89 
 
 		 1685 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  32.18 
 
 		 1614 aa  768    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  31.93 
 
 		 1613 aa  742    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1382 aa  740    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  32.66 
 
 		 1613 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  34.42 
 
 		 1614 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  32.54 
 
 		 1586 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1600 aa  714    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  31.97 
 
 		 1553 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  31.82 
 
 		 1621 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  36.41 
 
 		 1625 aa  782    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  31.43 
 
 		 1624 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  32.75 
 
 		 1595 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  32.5 
 
 		 1605 aa  770    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  31.96 
 
 		 1620 aa  725    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  33.21 
 
 		 1653 aa  708    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  32.24 
 
 		 1614 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  32.16 
 
 		 1602 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  32.91 
 
 		 1611 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  30.88 
 
 		 1626 aa  759    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  31.11 
 
 		 1618 aa  775    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  33.23 
 
 		 1614 aa  790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  31.7 
 
 		 1614 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  32.68 
 
 		 1685 aa  747    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  32.3 
 
 		 1614 aa  780    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  32.73 
 
 		 1622 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  30.95 
 
 		 1619 aa  763    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  32.66 
 
 		 1621 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  34.02 
 
 		 1615 aa  738    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>