175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1728 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  87.06 
 
 		 686 aa  1248    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  72.5 
 
 		 986 aa  1498    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 		 992 aa  2029    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.21 
 
 		 986 aa  1519    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  62.55 
 
 		 992 aa  1278    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  66.91 
 
 		 1004 aa  1353    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  75.08 
 
 		 986 aa  1558    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  35.04 
 
 		 984 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.96 
 
 		 1017 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.36 
 
 		 981 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  34.08 
 
 		 1008 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.06 
 
 		 1003 aa  341  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  29.83 
 
 		 1097 aa  305  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  32.5 
 
 		 1056 aa  243  9e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  32.57 
 
 		 1055 aa  234  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  32.08 
 
 		 1096 aa  227  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.6 
 
 		 1617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.58 
 
 		 1550 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.83 
 
 		 1618 aa  114  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.5 
 
 		 1614 aa  112  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  26.45 
 
 		 1651 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  26.88 
 
 		 1685 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.16 
 
 		 1617 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  25.26 
 
 		 1685 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  25.53 
 
 		 1605 aa  110  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.73 
 
 		 1642 aa  107  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  27.03 
 
 		 1601 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  25.76 
 
 		 1638 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.17 
 
 		 1617 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  25.76 
 
 		 1638 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  25 
 
 		 1613 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.91 
 
 		 1612 aa  104  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.12 
 
 		 1616 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  26.01 
 
 		 1615 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.15 
 
 		 1590 aa  103  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.47 
 
 		 1628 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.92 
 
 		 1609 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  26.83 
 
 		 1622 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  25.16 
 
 		 1591 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  23.64 
 
 		 1611 aa  101  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.47 
 
 		 1623 aa  101  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.75 
 
 		 1613 aa  101  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  25.12 
 
 		 1622 aa  101  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  27.08 
 
 		 1613 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1119 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  26.28 
 
 		 1627 aa  99.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.32 
 
 		 1625 aa  99  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.82 
 
 		 1586 aa  99  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.83 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.55 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.55 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  25.23 
 
 		 1595 aa  98.6  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  23.66 
 
 		 1614 aa  97.8  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1119 aa  97.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.42 
 
 		 1614 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.17 
 
 		 1613 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  24.17 
 
 		 1613 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  24.17 
 
 		 1613 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  26.79 
 
 		 1595 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  24.33 
 
 		 1613 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.37 
 
 		 1634 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.99 
 
 		 1585 aa  95.9  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 		 1591 aa  96.3  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  26.03 
 
 		 1623 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  22.82 
 
 		 1614 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  24.33 
 
 		 1613 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.5 
 
 		 1614 aa  94.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.42 
 
 		 1619 aa  94.7  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  22.97 
 
 		 1614 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  22.97 
 
 		 1614 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.63 
 
 		 1582 aa  94.4  9e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  24.86 
 
 		 1614 aa  94.7  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  26.16 
 
 		 1625 aa  94.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1122 aa  94  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  23.83 
 
 		 1613 aa  94  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  22.97 
 
 		 1614 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.95 
 
 		 1583 aa  94  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.83 
 
 		 1613 aa  94.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  23.81 
 
 		 1614 aa  94  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  24.9 
 
 		 1674 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 		 1610 aa  94  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  24.27 
 
 		 1642 aa  94  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  25.87 
 
 		 1656 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  23.91 
 
 		 1630 aa  93.2  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  26.81 
 
 		 1615 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.42 
 
 		 1626 aa  93.6  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.27 
 
 		 1643 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  24.48 
 
 		 1594 aa  92.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.39 
 
 		 1620 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.13 
 
 		 1620 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  26.47 
 
 		 1614 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.6 
 
 		 1639 aa  92.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  22.83 
 
 		 1614 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.87 
 
 		 1613 aa  92  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  22.87 
 
 		 1614 aa  91.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  23.75 
 
 		 1653 aa  91.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  23 
 
 		 1614 aa  91.3  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  23.83 
 
 		 1621 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  23.83 
 
 		 1621 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  26.46 
 
 		 1586 aa  90.1  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>