220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00180 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  49.95 
 
 
1096 aa  1025    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  100 
 
 
1056 aa  2191    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  45.87 
 
 
1055 aa  852    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.92 
 
 
981 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.35 
 
 
1017 aa  312  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  33.28 
 
 
984 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.97 
 
 
1003 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  31.08 
 
 
1097 aa  291  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  33.8 
 
 
1008 aa  290  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  31.76 
 
 
1004 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  30.65 
 
 
992 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.66 
 
 
992 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  31.53 
 
 
986 aa  244  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  31.76 
 
 
986 aa  244  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  31.85 
 
 
986 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  31.27 
 
 
686 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 
1663 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 
1621 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 
1621 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  25.9 
 
 
1627 aa  90.1  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 
1674 aa  90.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  26.99 
 
 
1621 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  26.24 
 
 
1651 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  25.09 
 
 
1119 aa  89  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  26.5 
 
 
1119 aa  89  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.56 
 
 
1643 aa  89  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.65 
 
 
1617 aa  88.2  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  23.16 
 
 
1605 aa  88.2  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.99 
 
 
1586 aa  87.8  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.84 
 
 
1613 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  26.83 
 
 
1685 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  26.7 
 
 
1610 aa  85.9  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  27.04 
 
 
1619 aa  85.1  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 
1663 aa  85.1  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  24.53 
 
 
1622 aa  85.1  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.81 
 
 
1617 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  23.87 
 
 
1404 aa  85.1  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  27.04 
 
 
1626 aa  84.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.37 
 
 
1569 aa  84  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  25.84 
 
 
1586 aa  83.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.86 
 
 
1617 aa  83.2  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.58 
 
 
1628 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  26.15 
 
 
1614 aa  82.8  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.63 
 
 
1614 aa  83.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.05 
 
 
1634 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  26.27 
 
 
1614 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  24.78 
 
 
1663 aa  82  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003435  NAD-specific glutamate dehydrogenase large form  23.87 
 
 
1613 aa  81.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.95 
 
 
1618 aa  81.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  24.12 
 
 
1618 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  26.1 
 
 
1685 aa  80.9  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  26.05 
 
 
1614 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.2 
 
 
1550 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  26.59 
 
 
1614 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  26.05 
 
 
1614 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  26.05 
 
 
1614 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  26.42 
 
 
1591 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  26.9 
 
 
1591 aa  79.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.86 
 
 
1639 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.91 
 
 
1590 aa  79  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  23.42 
 
 
985 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0586845  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  22.9 
 
 
1586 aa  79  0.0000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  26.09 
 
 
1653 aa  78.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  25.66 
 
 
1614 aa  79  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  23.54 
 
 
1574 aa  78.6  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.89 
 
 
1614 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.89 
 
 
1614 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  25.43 
 
 
1614 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.48 
 
 
1620 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.43 
 
 
1583 aa  78.2  0.0000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  23.24 
 
 
1382 aa  78.2  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  28.18 
 
 
1601 aa  78.2  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  22.57 
 
 
1646 aa  78.2  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  24.72 
 
 
1618 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.48 
 
 
1620 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.66 
 
 
1614 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  24.51 
 
 
1618 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18860  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  23.71 
 
 
1621 aa  76.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.73 
 
 
1658 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.263368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  25.75 
 
 
1595 aa  77  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.65 
 
 
1613 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.95 
 
 
1613 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.62 
 
 
1612 aa  75.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  27.8 
 
 
1614 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  25.92 
 
 
1602 aa  75.1  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.89 
 
 
1582 aa  75.1  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  25.49 
 
 
1600 aa  74.7  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  25.49 
 
 
1600 aa  74.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  24.64 
 
 
1625 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  24.23 
 
 
1613 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.14 
 
 
1630 aa  74.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  23.66 
 
 
1595 aa  74.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  22.14 
 
 
1615 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  22.62 
 
 
1614 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  22.92 
 
 
1614 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.65 
 
 
1623 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  25.92 
 
 
1611 aa  72.8  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.38 
 
 
1553 aa  72.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  23.5 
 
 
1614 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.16 
 
 
1585 aa  72  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>