171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0111 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  69.68 
 
 		 686 aa  1000    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  66.91 
 
 		 992 aa  1350    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  58.79 
 
 		 992 aa  1197    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  65.61 
 
 		 986 aa  1324    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  65.16 
 
 		 986 aa  1320    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  100 
 
 		 1004 aa  2070    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  67.14 
 
 		 986 aa  1355    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.95 
 
 		 1017 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  34.94 
 
 		 984 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  32.14 
 
 		 1008 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.29 
 
 		 981 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.01 
 
 		 1003 aa  350  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  29.85 
 
 		 1097 aa  311  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  31.76 
 
 		 1056 aa  258  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  31.89 
 
 		 1096 aa  251  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  32.15 
 
 		 1055 aa  241  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  24.87 
 
 		 1617 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.43 
 
 		 1617 aa  125  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.42 
 
 		 1617 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.64 
 
 		 1618 aa  121  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  26.19 
 
 		 1630 aa  117  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  25.52 
 
 		 1651 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  24.67 
 
 		 1642 aa  116  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.42 
 
 		 1586 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  25.57 
 
 		 1653 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  26.08 
 
 		 1590 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  26.09 
 
 		 1585 aa  111  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  26.1 
 
 		 1610 aa  111  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.75 
 
 		 1584 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.35 
 
 		 1616 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  26.69 
 
 		 1685 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.81 
 
 		 1613 aa  109  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.72 
 
 		 1643 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.47 
 
 		 1614 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  23.43 
 
 		 1623 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  23.88 
 
 		 1674 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1600 aa  107  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1600 aa  107  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  25.48 
 
 		 1622 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.11 
 
 		 1612 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.34 
 
 		 1625 aa  106  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.33 
 
 		 1623 aa  104  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1382 aa  104  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.37 
 
 		 1613 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.32 
 
 		 1553 aa  104  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  24.25 
 
 		 1656 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  25.7 
 
 		 1627 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  24.62 
 
 		 1602 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  24.65 
 
 		 1622 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  26.11 
 
 		 1685 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 		 1586 aa  102  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.91 
 
 		 1550 aa  101  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  24.02 
 
 		 1614 aa  101  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 		 1638 aa  101  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 		 1638 aa  101  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  23.45 
 
 		 1594 aa  101  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  24.38 
 
 		 1601 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  22.96 
 
 		 1618 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  23.97 
 
 		 1613 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1614 aa  99.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  23.57 
 
 		 1663 aa  100  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  23.45 
 
 		 1605 aa  100  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  23.63 
 
 		 1614 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  23.6 
 
 		 1663 aa  99.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  24.04 
 
 		 1627 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  23.63 
 
 		 1614 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  24.66 
 
 		 1613 aa  99.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  23.63 
 
 		 1614 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  23.21 
 
 		 1614 aa  99  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  23.2 
 
 		 1613 aa  98.6  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.91 
 
 		 1614 aa  98.2  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  24.22 
 
 		 1615 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  23.76 
 
 		 1634 aa  98.2  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003435  NAD-specific glutamate dehydrogenase large form  23.13 
 
 		 1613 aa  97.8  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.43 
 
 		 1614 aa  98.2  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.14 
 
 		 1609 aa  98.2  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.77 
 
 		 1614 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.77 
 
 		 1614 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  23.49 
 
 		 1614 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  23.7 
 
 		 1621 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  24.24 
 
 		 1595 aa  96.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1122 aa  95.9  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.54 
 
 		 1582 aa  95.9  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 		 1613 aa  96.3  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 		 1613 aa  96.3  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 		 1613 aa  96.3  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  23.57 
 
 		 1624 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1119 aa  95.5  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 		 1613 aa  95.9  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  23.52 
 
 		 1663 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  24.9 
 
 		 1615 aa  95.5  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.2 
 
 		 1613 aa  95.1  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.43 
 
 		 1619 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.43 
 
 		 1619 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  24.21 
 
 		 1615 aa  95.1  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  23.7 
 
 		 1621 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  23.79 
 
 		 1590 aa  94.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  23.89 
 
 		 1621 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  24.81 
 
 		 1591 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  24.04 
 
 		 1612 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>