149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0272 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  44.03 
 
 		 1613 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  40.32 
 
 		 1613 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  38.79 
 
 		 1663 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  40.95 
 
 		 1613 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  41.13 
 
 		 1638 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  36.44 
 
 		 1621 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1614 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1618 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  42.61 
 
 		 1119 aa  664    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  42.49 
 
 		 1119 aa  663    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  43.78 
 
 		 1614 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  41.56 
 
 		 1618 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.03 
 
 		 1619 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.68 
 
 		 1617 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  37.65 
 
 		 1613 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  33.89 
 
 		 1614 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  40.54 
 
 		 1617 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.03 
 
 		 1628 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  40.02 
 
 		 1634 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.23 
 
 		 1613 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  42.07 
 
 		 1614 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0272  NAD-glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 1518 aa  2978    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003435  NAD-specific glutamate dehydrogenase large form  37.16 
 
 		 1613 aa  646    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  45 
 
 		 1646 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  40.89 
 
 		 1590 aa  666    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.51 
 
 		 1627 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.95 
 
 		 1628 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.3 
 
 		 1613 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  36.18 
 
 		 1614 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  39.87 
 
 		 1612 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  43.03 
 
 		 1619 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.22 
 
 		 1623 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  40.32 
 
 		 1613 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  39.04 
 
 		 1625 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.73 
 
 		 1618 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  36.05 
 
 		 1612 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  37.95 
 
 		 1591 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.32 
 
 		 1614 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.32 
 
 		 1614 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.06 
 
 		 1616 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  37.87 
 
 		 1615 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  41.06 
 
 		 1609 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  39.83 
 
 		 1613 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  43.62 
 
 		 1620 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.4 
 
 		 1617 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  40.32 
 
 		 1613 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  41.13 
 
 		 1638 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.23 
 
 		 1614 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.39 
 
 		 1584 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  45.46 
 
 		 1622 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1613 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  36.04 
 
 		 1601 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  38.12 
 
 		 1626 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  37.59 
 
 		 1614 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  41.58 
 
 		 1585 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  42.84 
 
 		 1615 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  33.89 
 
 		 1614 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  43.86 
 
 		 1656 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  38.17 
 
 		 1614 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  39.45 
 
 		 1591 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  45.94 
 
 		 1614 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  38.53 
 
 		 1614 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.32 
 
 		 1613 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  39.83 
 
 		 1613 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  42.16 
 
 		 1586 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  37.54 
 
 		 1553 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  38.7 
 
 		 1621 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  42.8 
 
 		 1620 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  44.52 
 
 		 1614 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  33.89 
 
 		 1614 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  48.93 
 
 		 1614 aa  661    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  43.16 
 
 		 1611 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  39.04 
 
 		 1626 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  34.09 
 
 		 1618 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  37.89 
 
 		 1614 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  36.47 
 
 		 1614 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  33.89 
 
 		 1614 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  40.57 
 
 		 1622 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  38.84 
 
 		 1619 aa  659    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  38.7 
 
 		 1621 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  41.34 
 
 		 1615 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  41.34 
 
 		 1621 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  38.74 
 
 		 1658 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  37.92 
 
 		 1625 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02008  NAD-specific glutamate dehydrogenase  36.65 
 
 		 1511 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  38.73 
 
 		 1674 aa  636  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  44.53 
 
 		 1625 aa  636  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  45.47 
 
 		 1651 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  39.92 
 
 		 1595 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  37.72 
 
 		 1625 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  40.39 
 
 		 1590 aa  632  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  42.27 
 
 		 1610 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  34.66 
 
 		 1663 aa  630  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  37.43 
 
 		 1605 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  44.65 
 
 		 1685 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1600 aa  628  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  34.5 
 
 		 1663 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  41.36 
 
 		 1572 aa  626  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  37.01 
 
 		 1382 aa  629  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1600 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>