131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3679 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  49.76 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  47.64 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  47.64 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  47.64 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  45.97 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  45.85 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  39.45 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  32.92 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.97 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  37.98 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  33.98 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  34.15 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  33.65 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  32.23 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  34.34 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.17 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  34.29 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.22 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.24 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.92 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.65 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.82 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  33.5 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  32.52 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  32.39 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.65 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.18 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.52 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  32.7 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.66 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  31.48 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  34.78 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  31.03 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  36.71 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  27.88 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.09 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.09 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.4 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  33.5 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  28.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  34.88 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  27.49 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  27.49 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  27.49 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  27.49 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.17 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  26.1 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  27.04 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.44 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  23.39 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  27.65 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  24.36 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  26.73 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  29.36 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.05 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  29.05 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  28.02 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.11 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.73 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.7 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.11 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  25.61 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.84 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.36 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  31.55 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.86 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  30.24 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  34.38 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.36 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.15 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.84 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  28.73 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25.32 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  23.15 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  31.66 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  24.42 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  29.03 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.8 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>