174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0217 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  463  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  71.64 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  65.26 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  59.07 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  63.18 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  62.61 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  62.38 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  43.28 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  43.72 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  41.38 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  44.19 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  42.65 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  41.71 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  39.91 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  39.91 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  45.41 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  40.34 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  40.09 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  42.61 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  35.68 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  36.4 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  38.62 
 
 		 281 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  42.65 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  38.65 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  35.92 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  36.4 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  36.59 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  35.22 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  32.54 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  31.62 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.61 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  40.71 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  31.2 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  32.02 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  38.05 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  32.91 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.86 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  40.1 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  32.86 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.92 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  36.41 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.88 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  36.41 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  30.6 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  33.19 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  33.19 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  33.19 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  31.86 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  32.35 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  29.06 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  31.67 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  30.59 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  31.07 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  29.89 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  31.05 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  34.45 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.18 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  32.63 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  31.22 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  31.22 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  32 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  32 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  29.5 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  31.22 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  32.61 
 
 		 220 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  30.69 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  31.22 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  29.51 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  35.07 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  33.65 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.28 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  26.5 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  30.16 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  29.15 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  30.51 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  30.67 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.7 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  29.41 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  29.56 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  30.38 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>