167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_974 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  90.55 
 
 		 254 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  90.16 
 
 		 254 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  38.39 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  35.09 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  33.82 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.08 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.08 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  33.18 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.05 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.68 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  33.66 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  32.55 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.58 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  33.02 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  32.7 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  32.7 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  30.28 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  30.28 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  30.28 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  30.39 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  35.14 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31.6 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  33.51 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  31.28 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  31.9 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  33.49 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30.99 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  33.98 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  36.54 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.25 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  30.17 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  33.17 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.2 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  32.85 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  31.19 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  33.02 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.28 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.9 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.93 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  33.17 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.19 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  32.54 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  29.48 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  32.69 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  31.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  31.14 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.69 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.21 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.21 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.6 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.64 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  28.39 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  33.49 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  30.36 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  34.68 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  29.82 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  30.84 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.82 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.14 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  30.91 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.13 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.52 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  32.75 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  31.25 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  28.02 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  30.49 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  32.64 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  27.86 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  33.13 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  30.22 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  31.74 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  29.59 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.85 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  28.22 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  27.22 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.15 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>