183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2937 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  86.99 
 
 
245 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  62.96 
 
 
264 aa  261  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  54.73 
 
 
242 aa  250  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  54.07 
 
 
251 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  51.95 
 
 
250 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  51.95 
 
 
234 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  54.78 
 
 
248 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  42.21 
 
 
248 aa  185  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  43.88 
 
 
251 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  45.33 
 
 
251 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  43.51 
 
 
237 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  38.33 
 
 
245 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  37.93 
 
 
235 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  40.16 
 
 
245 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  43.46 
 
 
239 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  44.94 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  42.03 
 
 
251 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  40.91 
 
 
236 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  36.99 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  33.63 
 
 
244 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  38.21 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  35.66 
 
 
244 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  37.8 
 
 
281 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  39.42 
 
 
234 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  33.87 
 
 
251 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  41.08 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  41.03 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  41.03 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  32.86 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  32.86 
 
 
242 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  35.45 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  34.75 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  37.89 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.03 
 
 
236 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  33.83 
 
 
238 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  34.58 
 
 
250 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  30.81 
 
 
237 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  36.97 
 
 
240 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  30.8 
 
 
256 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  29.61 
 
 
231 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  29.36 
 
 
235 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  34.03 
 
 
234 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  30.33 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  30.81 
 
 
237 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  30.33 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  30.33 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  37.14 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  29.68 
 
 
231 aa  98.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.72 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.31 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  30.48 
 
 
241 aa  95.5  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  32.53 
 
 
247 aa  95.1  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.76 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  33.01 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.01 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.09 
 
 
229 aa  92  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  30.3 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  33.7 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  32.22 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  27.16 
 
 
238 aa  89  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.64 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  32.06 
 
 
220 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  33.64 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.86 
 
 
265 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  29.46 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  31.35 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  35.15 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  27.7 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  29.05 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  29.69 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  29.69 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  30.04 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  29.69 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.55 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  30 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  36.4 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  31.22 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  31.78 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>