161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0760 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  511  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  42.47 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  35.22 
 
 
237 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  32.66 
 
 
243 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.82 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.6 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  29.95 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  29.38 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  28.74 
 
 
245 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.8 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  30.33 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  31.13 
 
 
232 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.84 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  32.54 
 
 
240 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  32.23 
 
 
237 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.44 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.7 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.7 
 
 
234 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.7 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.33 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  31.76 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  28.9 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  32.56 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  29.48 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.42 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.78 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  32.16 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.13 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  27.98 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  28.44 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.55 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  30.99 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  25.79 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.22 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  31.42 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  28.21 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  26.92 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.89 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.44 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  27.78 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  28.26 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  27.9 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  32.91 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.83 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  26.45 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.56 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  28.97 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.34 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  28.31 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  29.82 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  25.82 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  24.88 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.25 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  28.77 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  27.73 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.63 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  27.49 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  31.82 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.55 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.11 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  23.67 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  29.68 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.23 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  29.38 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  24.42 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  24.07 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  28.84 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  26.82 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.43 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  25.35 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  24.19 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  25.13 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.63 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.63 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>