137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0981 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  42.6 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  40.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  42.86 
 
 
242 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  39.01 
 
 
243 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  32.38 
 
 
242 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  29.82 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  33.48 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  36.72 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.88 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.55 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.46 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.96 
 
 
251 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  30.66 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  30.09 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.73 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  27.48 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30.99 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  29.63 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  28.77 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.35 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.04 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  28.81 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  32.77 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.31 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.23 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.31 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  30 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  29.39 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.96 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  29.52 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  28.14 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  28.92 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  28.92 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  28.92 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30.34 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  28.92 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  28.92 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  30.48 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  28.5 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  28.31 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  28.92 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  28.86 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  31.52 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.93 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  28.37 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  28.45 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.71 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  28.24 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  28.44 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.06 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  28.25 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  31.45 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.69 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  27.53 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  29.82 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  24.07 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.23 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  28.44 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  24.89 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  29.58 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  27.86 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  27.98 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  27.1 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.72 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  29.72 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  25.14 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  25.69 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  27.03 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.03 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.03 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  26.79 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  27.43 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  24.31 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  25.99 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  27.96 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2069  protein of unknown function DUF541  29.8 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2733  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  25.83 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  24.78 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  25.93 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  29.58 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  27.7 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  22.17 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  27.51 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  27.23 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  23.87 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  27.5 
 
 
157 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  22.12 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  28.38 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  22.69 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00770  hypothetical protein  30.84 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.63 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  24.32 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>