152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1457 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25.51 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  24.48 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  31.73 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  31.4 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  30.92 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  30.14 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  28.69 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  28.5 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  29.47 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  30.56 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  25.12 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  26.48 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  27.31 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.28 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.13 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.5 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  34.62 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  25.59 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  26.56 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  24.05 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  24.44 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  26.54 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  31.13 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.21 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.94 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.64 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  27.65 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  28.97 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  28.97 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.02 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  25.12 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  24.88 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00770  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  28.11 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30.19 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  30.04 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  29.07 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  23.05 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.88 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  24.6 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  27.83 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  25.57 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  24.88 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  23.79 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.75 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  30.39 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  35.19 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  23.75 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  35.19 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  31.92 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  29.72 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  23.12 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  27.49 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  26.07 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  26.05 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  24.89 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  29.49 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  24.88 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  24.38 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  25.35 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  30.41 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  26.42 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  30.41 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  26 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  23.6 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  24.42 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  26.73 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  27.84 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  23.72 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  31.63 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  23.89 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  23.15 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  26.39 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>