149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2585 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  40.58 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  39.63 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  32.93 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  36.19 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  32.93 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.97 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.58 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.35 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  30.4 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  32.09 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  31.29 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  34.54 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  33.14 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  34.73 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  31.1 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  32.5 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.73 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  30.93 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  31.95 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.37 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.37 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.37 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  30.13 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  38.52 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  30.37 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  31.36 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.12 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.36 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  27.55 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  33.54 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.14 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.1 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.71 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  34.57 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.82 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.82 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  24.57 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  31.58 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.28 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.49 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  28.89 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.55 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.95 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.95 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.95 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  29.86 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  28.9 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  31.93 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  28.87 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.7 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.63 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  28.83 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.23 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.56 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.99 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.23 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  28.22 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  29.82 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  26.63 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.55 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.4 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.99 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  28.98 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  22.54 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  28.95 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.42 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  25.16 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  29.13 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  23.58 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  26.99 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  27.03 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  24.53 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  24.53 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  24.53 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  24.53 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  28.44 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.11 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25.16 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  23.32 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  24.53 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  25.13 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  24.53 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  30.38 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  30.38 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  30.38 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>