185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1932 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  45.15 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  45.19 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  43.2 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  48.04 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  41.43 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  38.79 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  39.43 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  41.02 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  41.83 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  40.47 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  39.52 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  48.78 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  48.78 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  38.97 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  38.97 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  37.4 
 
 		 232 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  40.98 
 
 		 240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  43.96 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  44.12 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  35.05 
 
 		 248 aa  132  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  40.19 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  41.63 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  37.62 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  33.66 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  38.16 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  33.66 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  39.17 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  39.81 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  41.55 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  41.26 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  37.33 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  37.32 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  40.69 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  33.96 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  35.75 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  36.97 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  31.3 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  30.69 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  35.58 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  35.58 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.8 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  32.55 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.02 
 
 		 229 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  34.47 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  33 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  31.9 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  36 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  34.95 
 
 		 248 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  31.22 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  36 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  31.85 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  37.8 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  33.5 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.28 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  30.92 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  28.38 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  32.1 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  33.91 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  29.13 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  34.43 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2069  protein of unknown function DUF541  33.19 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  28.11 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.55 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  34.6 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  27.18 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  28.88 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  30.14 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  29.72 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.12 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  34.91 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  33.49 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  28.97 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  32.39 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.94 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  35.32 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.94 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.67 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>