130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1123 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  46.22 
 
 
242 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  42.8 
 
 
245 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  37.19 
 
 
249 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  39.01 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  37.02 
 
 
245 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.96 
 
 
251 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 
236 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  31.08 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.03 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  31.35 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  89  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  32.57 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  31.31 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  31.08 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  32.11 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  32.56 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  31.31 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  31.31 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  31.56 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  32 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  31.31 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31.56 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  31.31 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  31.12 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  32.57 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  31.12 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  29.91 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  29.32 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.85 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  30.08 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  30.88 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  28.51 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  29.72 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.23 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.64 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  29.77 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.85 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  28.77 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  27.97 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  25.59 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  25.35 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  27.94 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  28.05 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  32.24 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  27.76 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  31.03 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  32 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  28.19 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  27.36 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.63 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.02 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  26.89 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  27.89 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  30.52 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.16 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.14 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  32.14 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.14 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.12 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  34.36 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.33 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2904  protein of unknown function DUF541  26.98 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.369203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  26.39 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  27.01 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  30.54 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  29.55 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.57 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  28.08 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  30.95 
 
 
157 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  24.31 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  26.32 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.52 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  27.47 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  30.43 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2069  protein of unknown function DUF541  28.12 
 
 
286 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  24.76 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2733  protein of unknown function DUF541  28.85 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  25 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  26.14 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.98 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  28.77 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  29.37 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  27.96 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.8 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0620  hypothetical protein  28.69 
 
 
234 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.628729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  22.9 
 
 
236 aa  52  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3813  protein of unknown function DUF541  34.74 
 
 
355 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  28.26 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  26.26 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  26.86 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  27.61 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  26.88 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>