89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0620 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.628729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  44.3 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  46.26 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4429  protein of unknown function DUF541  43.97 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4493  protein of unknown function DUF541  43.97 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2069  protein of unknown function DUF541  45.29 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3080  protein of unknown function DUF541  43.64 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.52 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.45 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  28.81 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.05 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  26.47 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  31.1 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  24.1 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  31.4 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.91 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  24.78 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  31.75 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  26.64 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.71 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  26.91 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  28.29 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.49 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  29.45 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  29.03 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  27.66 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  30.85 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.23 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  29.6 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.46 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.56 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.33 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.91 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.51 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.59 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  29.56 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.06 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.1 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  28.08 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.74 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  27.8 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.08 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  30.73 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  29.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  25.25 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  27.23 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  26.67 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.14 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  30.21 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  28.97 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  24.14 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  25.37 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.25 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  33.02 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25.37 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  23.76 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  24.46 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  24.88 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  25.37 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.92 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  24.88 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.75 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  26.05 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  26.05 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  26.05 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  27.83 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  24.11 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.22 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  25.98 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  33.65 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  24.24 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  24.24 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  28.25 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  29.77 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  30.62 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  28.37 
 
 		 241 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  23.26 
 
 		 234 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  34.55 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>