190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2073 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  55.87 
 
 
251 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  54.51 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  54.96 
 
 
250 aa  248  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  56.58 
 
 
234 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  55.86 
 
 
246 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  57.34 
 
 
264 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  48.54 
 
 
248 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  51.06 
 
 
251 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  38.89 
 
 
248 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  44.65 
 
 
251 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  43.46 
 
 
245 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  42.65 
 
 
237 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  43.21 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  39.46 
 
 
240 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  47.44 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  47.44 
 
 
230 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  37.91 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  43.19 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  41.71 
 
 
239 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  41.1 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  35.89 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  34.73 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  34.02 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  35.39 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  39.26 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  35.54 
 
 
251 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  32.77 
 
 
243 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  41.63 
 
 
237 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  32.37 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  38.28 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  39.34 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  32.37 
 
 
242 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  36.02 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  37.44 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  36.24 
 
 
250 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  35.87 
 
 
236 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  34.02 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  35.68 
 
 
254 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  35.38 
 
 
241 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  35.38 
 
 
241 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  35.38 
 
 
241 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  31.56 
 
 
236 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  31.56 
 
 
236 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  31.56 
 
 
236 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  28.76 
 
 
231 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  39.23 
 
 
241 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  33.47 
 
 
237 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  34.2 
 
 
238 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  34.91 
 
 
249 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  38.1 
 
 
254 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  30.58 
 
 
234 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  32.5 
 
 
256 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  31.33 
 
 
241 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  35.68 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  33.96 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.94 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  34.12 
 
 
242 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  31.63 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  34.12 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  31.31 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  31.13 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  29.95 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  35.35 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.65 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  34.11 
 
 
242 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  34.29 
 
 
240 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  35.42 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  34.56 
 
 
265 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  31.56 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  34 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.44 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30.67 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  33.02 
 
 
243 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  33.64 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.39 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.14 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  31.95 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  31.15 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  35.27 
 
 
239 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  28.18 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  28.81 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  29.49 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  28.81 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  30.94 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.61 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.22 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  28.4 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.22 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  28.05 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>