160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4941 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  51.71 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  51.27 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  47.17 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  53.12 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  46.48 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  34.58 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  32.37 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.72 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  31.9 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  30.89 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  34.12 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.23 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.8 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  30.7 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.8 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  28.71 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30.37 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  28.96 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  32.35 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.18 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.7 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.97 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  28.63 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  26.63 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  32.18 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  29.7 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  30.74 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  28.72 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  27.01 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.66 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.29 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.59 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  34.13 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  30.06 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  30.06 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  30.06 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  30.06 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  34.58 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  30.88 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.48 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  29.67 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  33.81 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  26.27 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  30.13 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  31.1 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.04 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  36.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  36.8 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  36.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  36.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.9 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  29.48 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  28.92 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  30.94 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  23.88 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  31.63 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  31.41 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.38 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  29.38 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  29.06 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  32.43 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  27.75 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  24.11 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.54 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.16 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.16 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  23.71 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25.24 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  30.25 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  29.15 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  26.12 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>