166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1191 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  89.37 
 
 
254 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  90.16 
 
 
254 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  35.47 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  35.27 
 
 
243 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  36.02 
 
 
251 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.05 
 
 
245 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.08 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.08 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.08 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.7 
 
 
251 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  32.6 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  32.6 
 
 
234 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.58 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.6 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  33.18 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  31.96 
 
 
244 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  32.23 
 
 
223 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  32.23 
 
 
219 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  32.23 
 
 
223 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  32.7 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  31.75 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  33.66 
 
 
220 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  32.55 
 
 
256 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  31.9 
 
 
245 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31.28 
 
 
223 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  31.25 
 
 
236 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.05 
 
 
242 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  30.81 
 
 
223 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  28.3 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30.66 
 
 
246 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  32.29 
 
 
244 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  31.69 
 
 
237 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  34.68 
 
 
246 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  34.58 
 
 
245 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  33.01 
 
 
240 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  30.73 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  29.33 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  31.46 
 
 
248 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  33.96 
 
 
244 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  33.65 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  28.85 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.19 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  28.92 
 
 
245 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  34.62 
 
 
241 aa  92  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  34.78 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  29.57 
 
 
233 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  27.8 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.95 
 
 
264 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  32.2 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  29.08 
 
 
242 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  31.07 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  30.69 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  30.08 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  32.7 
 
 
157 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  29.09 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  34.38 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  28.69 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.6 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.41 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  29.33 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  29.64 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.73 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.74 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.73 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  31.36 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  29.63 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  34.45 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  30.24 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  26.55 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  33.06 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  28.31 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.2 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.37 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  26.92 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  32.34 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  29.34 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  27.57 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  24.42 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  30.22 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  30.09 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.75 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  25.84 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  34.34 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  31.33 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  27.39 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  29.78 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  26.81 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  26.81 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  26.81 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  29.36 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>