163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0407 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  99.17 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  53.69 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  53.25 
 
 
245 aa  241  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  37.18 
 
 
244 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  38.28 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  35.74 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  37.04 
 
 
251 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  35 
 
 
245 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  32.37 
 
 
242 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  35.81 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  35.81 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  32.86 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.66 
 
 
281 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  31.2 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.63 
 
 
240 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  35.55 
 
 
264 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  31.25 
 
 
244 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  31.55 
 
 
245 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  29.18 
 
 
229 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.76 
 
 
235 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.33 
 
 
236 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.74 
 
 
232 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  32.05 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  31.64 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  30.2 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  33.03 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.02 
 
 
246 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  29.05 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  28.29 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.53 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.86 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.29 
 
 
251 aa  92  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  27.59 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.7 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.19 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.69 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.77 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.69 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.91 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.91 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.91 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  29.13 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  29.13 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  29.13 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  29.22 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  29.22 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  29.22 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  29.68 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.16 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.32 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  27.32 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  29.22 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  26.34 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.23 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  26.69 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  28.69 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  27.48 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.57 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  27.88 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  28.49 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.27 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.14 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.88 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  25.51 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  32.08 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  26.44 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  29.56 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  27.54 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  26.39 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  29.41 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  25.46 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.69 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  26.42 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.56 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  24.14 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  28.78 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  26.63 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  26.57 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  26.57 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  28 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.48 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  27.05 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  23.91 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  27.03 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  27.18 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.62 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>