176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1773 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  45.23 
 
 
242 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  42.6 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  42.8 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  37.89 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  36.07 
 
 
247 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  35.77 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  34.62 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.91 
 
 
251 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28 
 
 
229 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.67 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  35.51 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  32.38 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  34.45 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  36.15 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  32.78 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  31.6 
 
 
223 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  31.75 
 
 
223 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  31.6 
 
 
223 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  31.13 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.66 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  31.13 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  30.99 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  29.95 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  30.66 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  31.98 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  30.66 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.71 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.58 
 
 
220 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  31.6 
 
 
281 aa  89  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  29.2 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  31.16 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  30.19 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  33.83 
 
 
254 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  34.3 
 
 
243 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  31.6 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.92 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  29.58 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.32 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.1 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.06 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.01 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  32.13 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.49 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.64 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.52 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.67 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2904  protein of unknown function DUF541  31.8 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.369203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.43 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  28.46 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  31.8 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  28.97 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.24 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.24 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.11 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.91 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  29.05 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.73 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  30.88 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  29.07 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  28.27 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  28.51 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  26.1 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  27.7 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  29.66 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.25 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  25.89 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  25.21 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2733  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  28.84 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  30.69 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  31.29 
 
 
157 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  28.77 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.34 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  28.71 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  31.37 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  26.11 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.34 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  23.7 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  27.69 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  28.64 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.81 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.33 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.33 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.33 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.35 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  29.34 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  29.35 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  29.15 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3813  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 
355 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  27.78 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  23.47 
 
 
233 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>