153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13213 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  463  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  40.43 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  36.52 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.6 
 
 
237 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  25.1 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  27.47 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.05 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  24.46 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  29.56 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  24.89 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  28.18 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  26.72 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.76 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.75 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  27.65 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.73 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.41 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  28.7 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.16 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  26.92 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  25.42 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  24.06 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  26.27 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  25.22 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.05 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.67 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  26.43 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01998  putative periplasmic immunogenic protein  30.5 
 
 
190 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0383413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.47 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  26.73 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  24.8 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  26.92 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.5 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  26.97 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  26.44 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  24.52 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  26.5 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  26.5 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  26.5 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  26.5 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  25.59 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  25.65 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0966  hypothetical protein  28.57 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0086065  normal  0.762423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  26.05 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.88 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.27 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  26.29 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  25.48 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  27.73 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  25.59 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  24.26 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  26.83 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  25.88 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  28.99 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  24.46 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  23.7 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.12 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  26.21 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  26.7 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  27.68 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  24.42 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  23.83 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  21.76 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.21 
 
 
245 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  24.34 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  27.67 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  25.37 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  25.32 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  25.23 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  27.23 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  25.82 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.27 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>