169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0584 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  37.44 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  36.59 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  34.05 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  39.41 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  37.39 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  34.02 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.69 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  37.07 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  36.89 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  36.89 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  38.15 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  36.1 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  36.06 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.9 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.48 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  32.37 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  33.95 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  31.98 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.02 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.63 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.74 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.13 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.7 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  33.79 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  33.79 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  33.79 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.62 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.29 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  34.19 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.47 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.8 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  31.6 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  31.46 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  30.24 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  30.8 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.97 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  33.18 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.01 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.33 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.02 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.02 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  30.38 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  30.99 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.9 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.27 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  29.27 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  30.95 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  28.78 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  29.25 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  31.02 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  31.43 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  29.67 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  30.58 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  28.95 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  28.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28.26 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  28.81 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  27.91 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  28.18 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  26.89 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  26.79 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.57 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.57 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  30.24 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.57 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.57 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.57 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  24.26 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  30.17 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00770  hypothetical protein  29.44 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.41 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  27.31 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  22.94 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.19 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  30.09 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  31.02 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>