167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0791 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  44.54 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  43.21 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  48.06 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  42.79 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  38.59 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  49.15 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  49.15 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  39.57 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  40.34 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  40.47 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  40.47 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  41.9 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  39.73 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  39.42 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  41.9 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  42.31 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  37.44 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  35.94 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  38.73 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  34.67 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  30.21 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  39.32 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.73 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  37.42 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  31.55 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  38.54 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  35.44 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  31.55 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  31.38 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.63 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  31.07 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  34.21 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  36.06 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.27 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28.09 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  32.78 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  28.11 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.86 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  35.41 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.77 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  27.16 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.45 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  26 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.78 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  31.22 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  24.79 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  29.03 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  29.03 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  32.08 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  35.78 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  32.85 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  30.33 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  25.76 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  26.96 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.46 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  30.22 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  27.14 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  26.26 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  31.96 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.17 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  28.32 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.39 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.4 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.4 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  29.59 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.4 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  32.41 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.31 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.1 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  33.47 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.1 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>