161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0771 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  88.62 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  88.62 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  88.62 
 
 		 248 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  88.62 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  88.21 
 
 		 248 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  85.11 
 
 		 242 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  67.65 
 
 		 243 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  64.17 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  69.33 
 
 		 246 aa  314  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  63.75 
 
 		 259 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  63.75 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  71.82 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  69.2 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  62.34 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  37.18 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  39.52 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  39.52 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  39.52 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  37.74 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  35.44 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  35.04 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  37.21 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  34.5 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  36.4 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  37.38 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  35.81 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  38.57 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  32.22 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  32.19 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  30.05 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.72 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.91 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.53 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  32.31 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  29.55 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.97 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  32.8 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.98 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  28.43 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  29.06 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  28.69 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.35 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.95 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.04 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.9 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.2 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.74 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  28.04 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  29.2 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.28 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  34.19 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  31.89 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.45 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.95 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  29.33 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.81 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  26.62 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  25.97 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.76 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  25.32 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.11 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.07 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  25.32 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  31.52 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  24.88 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  24.68 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.23 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25.32 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  31.25 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  24.68 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  27.07 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  26.29 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.49 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  29.86 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  29.38 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>