163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2220 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01998  putative periplasmic immunogenic protein  39.36 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0383413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  34.91 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  29.9 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.54 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  31.22 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  28.09 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  32.13 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.61 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.14 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  31.14 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.29 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  28.71 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.57 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  28.86 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.36 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.13 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  27.57 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  29.95 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  27.78 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  26.96 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  28 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  27.98 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  26.73 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.36 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  28.26 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  26.57 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  27.71 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.61 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.61 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.74 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  25.66 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  26.18 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  25.45 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2814  hypothetical protein  27.65 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.379443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  26.16 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.88 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  26.11 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  26.07 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  25.73 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  26.24 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  22.54 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  24.54 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  24.54 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  26.09 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  25.62 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  24.78 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  27.84 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.78 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  27.88 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  24.14 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  23.58 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  21.78 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  23.58 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  25.23 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  26.01 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  25.35 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  22.94 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  23.66 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  25.73 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  26.96 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  26.96 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>