159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0558 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  77.52 
 
 
251 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  72.2 
 
 
246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  75.58 
 
 
246 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  71.78 
 
 
243 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  68.46 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  68.05 
 
 
259 aa  334  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  68.05 
 
 
266 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  63.6 
 
 
248 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  62.34 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  61.97 
 
 
242 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  37.18 
 
 
231 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  37.02 
 
 
238 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  35.98 
 
 
230 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  36.13 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  34.85 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  34.85 
 
 
237 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  34.85 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  34.85 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  34.85 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  37.04 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  35.22 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  35.22 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  37.8 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  35.22 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  33.76 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  34.18 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  34.93 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  32.92 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  34.3 
 
 
250 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  34.03 
 
 
235 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  32.62 
 
 
229 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  36.42 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  33.16 
 
 
202 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  27.7 
 
 
229 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.99 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  27.89 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.89 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  30.05 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.64 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.78 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.67 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  32.75 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  26.18 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  28.39 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.23 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  28.39 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  27.16 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.23 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  29.67 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  27.1 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.57 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  28 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  26.74 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.97 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.46 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  27.56 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.28 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  24.03 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.73 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  24.03 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.61 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.61 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.59 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.12 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.85 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.21 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25.63 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  30.69 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  28.98 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  27.75 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.46 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  30.48 
 
 
157 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  22.77 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>