146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2768 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 210 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  37.98 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  37.8 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  37.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  37.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  37.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  36.23 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  32.04 
 
 		 245 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  33.98 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  36.89 
 
 		 240 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  38.24 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  38.16 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  37.8 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  37.5 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  31.4 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  35.27 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  34.63 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  34.3 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  41.06 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  31.74 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  33.82 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  31.16 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  38.35 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.39 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  36.49 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  30.7 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  33.67 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.84 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  30.23 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  30.23 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.28 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  38.5 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.14 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.67 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  31.12 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  33.98 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  27.88 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  33.98 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  24.51 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.82 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  30.58 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  26.07 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  30.84 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  28.44 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  33.52 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  23.56 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  28.36 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  28.57 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  21.69 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  21.69 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  24.42 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  28.71 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  32.61 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  25.87 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.5 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  31.45 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  31.45 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  26.86 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  33.71 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.94 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  30.82 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  30.82 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  30.82 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  24.44 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  34.86 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.44 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.44 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.44 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  26.63 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  35.32 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  32.41 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.44 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  28.12 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  33.65 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>