140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2416 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  35.77 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  37.73 
 
 		 234 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  32.76 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  34.56 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  33.48 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  29.66 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.73 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.78 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  31.22 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.03 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  33.49 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.88 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.28 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  31.96 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  29.52 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  35 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  33.75 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.1 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  30.99 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.42 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  29.95 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.99 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  28.5 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  33.02 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.59 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  34.58 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  29.28 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  28.91 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.6 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  32.94 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.08 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.25 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.35 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  30.14 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.35 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  29.05 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.13 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  27.96 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  27.96 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  27.96 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.88 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.72 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  34.68 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  31.11 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.06 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  27.45 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  27.45 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  27.45 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  27.45 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.67 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  34.03 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  36.65 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  32.72 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  34.46 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  25.35 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  26.96 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  26.42 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  25.84 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.13 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.09 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  25.29 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  31.02 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.79 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  32.59 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  24.14 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  32.14 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  34.38 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  25.45 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.79 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.14 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  21.97 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>