156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3926 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  82.3 
 
 
259 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  81.89 
 
 
259 aa  411  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  81.89 
 
 
266 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  82.08 
 
 
246 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  82.01 
 
 
246 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  81.08 
 
 
251 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  71.78 
 
 
242 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  69.14 
 
 
248 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  68.72 
 
 
248 aa  324  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  68.72 
 
 
248 aa  324  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  68.72 
 
 
248 aa  324  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  68.72 
 
 
248 aa  324  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  67.65 
 
 
246 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  63.87 
 
 
242 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  38.24 
 
 
231 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  36.13 
 
 
230 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  38.94 
 
 
238 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  40.45 
 
 
238 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  40.09 
 
 
256 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  38.59 
 
 
236 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  38.59 
 
 
236 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  38.59 
 
 
236 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  36.02 
 
 
231 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  38.18 
 
 
237 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  36.29 
 
 
237 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  36.29 
 
 
237 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  36.29 
 
 
237 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  36.29 
 
 
237 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  37.08 
 
 
237 aa  141  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  37.61 
 
 
236 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  39.44 
 
 
238 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  39.05 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  35.83 
 
 
234 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  33.2 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  28.76 
 
 
229 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  34.18 
 
 
202 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  29.66 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.38 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  30.35 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  32.95 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.12 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.51 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.12 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  26.82 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  29.94 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.13 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.91 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  29.52 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.29 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  24.59 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.25 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  27.74 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  29.25 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.17 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  26.17 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.27 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  26.45 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  26.45 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  28.77 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  32.41 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.44 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  32.62 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  27.1 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  29.52 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  28.98 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.11 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25.74 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  28.64 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  29.21 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  23.18 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  25.41 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.28 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.14 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  26.19 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  27.81 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  27.59 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  26.63 
 
 
254 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.63 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.64 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>