82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0373 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  30.7 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  30.47 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  30.47 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  30.47 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  32.62 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  30.8 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  29.26 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  28.33 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  30.38 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.38 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.38 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.38 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.7 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.28 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  29.83 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  33.51 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.92 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.81 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.4 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  27.18 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  24.76 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  32.64 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  24.62 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  29.65 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  24.79 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  23.6 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  24.76 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  24.28 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  25.25 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  25.9 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.48 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  21.78 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  22.17 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  23.73 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  24.89 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  22.38 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  24.44 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  22.28 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  21.97 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  21.11 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  24.56 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  25.71 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  24.86 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  22.64 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  23.2 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  24.42 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  24.18 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  23.94 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  23.84 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  21.5 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  20.48 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  23.49 
 
 		 258 aa  42  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>