127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3310 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  77.16 
 
 		 202 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  36.56 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  34.3 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  33.89 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  34.67 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  34.57 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  34.01 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  34.01 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  33.6 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  30.51 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  32.22 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  34.07 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  32.63 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  33.51 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  33.15 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  33.16 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  33.16 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  33.16 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  32.29 
 
 		 237 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  31.77 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  32.29 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  31.77 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  34.36 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  31.77 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  32.12 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  31.51 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  29.11 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.45 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  30.16 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.11 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  31.87 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.42 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  26.22 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  24.17 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.29 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.74 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30.72 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.61 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  23.9 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.91 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  24.6 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3721  protein of unknown function DUF541  25.71 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.914927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.72 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.12 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  24.87 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  24.07 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.14 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  24.08 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  25.97 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  25.52 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  26.16 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  26.99 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  25.79 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  26.35 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  28.14 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.15 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  27.7 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  24 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  26.22 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.42 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.62 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  26.04 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  23.84 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  24.71 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  24.29 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  29.45 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0417  protein of unknown function DUF541  27.72 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  24.74 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.62 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  29.78 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  21.03 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  25.95 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.1 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  24.35 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  23.84 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  21.34 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  21.95 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  25.61 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>