40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3721 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3721  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.914927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  26.27 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  24.21 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  26.04 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.52 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25.14 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  26.73 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  23.59 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  24.67 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  23.56 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  23.89 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  23.89 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  24.48 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  23.56 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  24.74 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  24.08 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  23.02 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  23.56 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  22.4 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  21.88 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  21.56 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  23.04 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  23.04 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  23.04 
 
 
237 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  24.83 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  21.93 
 
 
236 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>