158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3406 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  99.6 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  99.6 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  85.19 
 
 		 242 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  65.35 
 
 		 259 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  67.9 
 
 		 243 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  64.96 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  64.96 
 
 		 266 aa  332  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  71.85 
 
 		 246 aa  331  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  72.4 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  71.31 
 
 		 251 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  63.6 
 
 		 242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  37.87 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  35.32 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  39.15 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  37.84 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  34.73 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  38.2 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  36.18 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  36.06 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  36.06 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  36.06 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  36.06 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  36.06 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  34.35 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  36.33 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  35.47 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  34.57 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  38.39 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  32.48 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.21 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  31.36 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  32.41 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  33.16 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.37 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  29.8 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.61 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  32.19 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  28.69 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.38 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  29.67 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  29.87 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  29.41 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  29.22 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  32.04 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  31.8 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  33.7 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  29.22 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  29.31 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.35 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.04 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.92 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  29.22 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  31.89 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.51 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  32.56 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.19 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  29.19 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.51 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.68 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  33.53 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.92 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.73 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  26.18 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  24.22 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.41 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.19 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  36.8 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  26.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  31.48 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  29.86 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  26.79 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  29.69 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.67 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  27.94 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.44 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>