202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2902 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  77.92 
 
 
244 aa  350  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  53.04 
 
 
242 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  53.04 
 
 
242 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  45.99 
 
 
244 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  47.41 
 
 
251 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  46.15 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  38.67 
 
 
251 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  39.75 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  38.1 
 
 
246 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  39.26 
 
 
248 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  37.25 
 
 
245 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  42.17 
 
 
281 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  40.45 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  37.05 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  35.68 
 
 
237 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  39.52 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  43.3 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  40.1 
 
 
250 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  40.1 
 
 
234 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  41.03 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  41.03 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  41.9 
 
 
259 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  37.25 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  37.07 
 
 
236 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  40.41 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  36.1 
 
 
243 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  40.1 
 
 
232 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  35.8 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  35.62 
 
 
235 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  38.35 
 
 
240 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  34.75 
 
 
233 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.36 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  37.95 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  32.24 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  40.1 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  33.49 
 
 
229 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  32.73 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  34.53 
 
 
241 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  34.53 
 
 
241 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  34.53 
 
 
241 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.33 
 
 
241 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  35.25 
 
 
247 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  35.75 
 
 
250 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  28.24 
 
 
238 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30.74 
 
 
254 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.74 
 
 
254 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  32.37 
 
 
242 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  32.37 
 
 
242 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  29.76 
 
 
256 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  32.37 
 
 
242 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  31.6 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  28.63 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  28.3 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  31.02 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  30.58 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.8 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.43 
 
 
231 aa  92  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.9 
 
 
236 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.9 
 
 
236 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.9 
 
 
236 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  29.45 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  32.58 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  28.8 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  29.51 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  29.51 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 
237 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  31.66 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  27.64 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  28.8 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  29.1 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.12 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  27.85 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  27.85 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  27.85 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  28.8 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  28.27 
 
 
223 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  28.27 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  28.87 
 
 
237 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.35 
 
 
276 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  27.08 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  31.77 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  28.27 
 
 
223 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  31.54 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  27.84 
 
 
259 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  28.27 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  28.63 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  27.75 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.75 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  36.04 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  27 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.92 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  27.2 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.02 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  27.83 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>