173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1094 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  78.97 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  49.15 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  47.44 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  42.68 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  42.08 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  41.59 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  43.87 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  41.84 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  42.99 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  40.74 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  46.95 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  43.61 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  48.78 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  42.72 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  39.62 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  40.34 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  39.64 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  39.27 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  35.29 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.61 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  36.02 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  41.04 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  40.49 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  38.92 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  32.74 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  36.89 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  33.49 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  39.43 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  32.69 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  32.69 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  34.18 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  36.79 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  40.1 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  35.47 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  35.1 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  35.1 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  29.61 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  30.28 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  30.81 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  35.1 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  31.43 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  30.09 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  31.06 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  31.9 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  29.52 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.13 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  30.04 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  33.48 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.09 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  31.03 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.38 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.56 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  28.77 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  28.63 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  34.05 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  27.15 
 
 		 251 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  31.68 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.5 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  31.16 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  29.95 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  35.59 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  27.01 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  27.01 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  27.01 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.27 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  27.67 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.19 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  34.12 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  34.12 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  34.12 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  26.73 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>