161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1883 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
242 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  98.35 
 
 
242 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  93.81 
 
 
242 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  59.05 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  35.85 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  39.32 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  37.07 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  36.41 
 
 
237 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.58 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  35.94 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  37.86 
 
 
236 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  36.84 
 
 
240 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.29 
 
 
246 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  32.59 
 
 
245 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.86 
 
 
254 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  34.16 
 
 
244 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  31.66 
 
 
281 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  34.16 
 
 
230 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  33.04 
 
 
244 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  31.9 
 
 
254 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.24 
 
 
243 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  35.41 
 
 
264 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  31.84 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  33.18 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  30.19 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  33.18 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.43 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  29.1 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.43 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  32.87 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  31.62 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  33.65 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  34.95 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.02 
 
 
245 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.71 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  33.6 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.86 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  33.73 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.15 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  31.12 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  28.43 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.79 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  27.45 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  27.45 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  27.45 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.45 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.45 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.94 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  32.55 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  26.96 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  26.96 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.05 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25.1 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  29.44 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  25.49 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  31.7 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  26.57 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  25.71 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.31 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  26.89 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  32.92 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.24 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  28.99 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  25.6 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  25.6 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  25.6 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  28.18 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  27.42 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  26.15 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  28.07 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  27.87 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  25.82 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  28.1 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  28.1 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  34.29 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  28.1 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.64 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.64 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>