160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0313 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  97.5 
 
 		 240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  87.89 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  51.39 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  52.53 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  49.77 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.42 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  32.84 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  35.98 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  37.85 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  31.76 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  31.71 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.49 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.79 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  36.84 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  34.05 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  32.3 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  34.05 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  31.02 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  34.87 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  36.26 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  30.05 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  31.94 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.46 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.72 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  35.07 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  29.63 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.96 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  35.23 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  31.49 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.56 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  26.5 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  26.53 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  29.13 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  33.81 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.7 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.7 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.95 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  27.66 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.66 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.66 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  30.18 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  33.13 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  33.87 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.72 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  28.23 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  27.51 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.45 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  27 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  25.97 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  26.78 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  31.61 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  26.78 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  26.78 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  25.66 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  26.5 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.18 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  26.16 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  27.96 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  34.09 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  28.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.48 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  29.21 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  34.83 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  30.09 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.46 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.46 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.46 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.65 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  27.4 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  27.4 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.04 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  25.96 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  25.24 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  26.6 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  35.61 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  25.24 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  28.71 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  32.11 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  25.98 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>