169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2980 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  55.27 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  54.71 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  48.62 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  54.42 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  48.54 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  46.67 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  47.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  45.2 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  39.74 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  37.17 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  42.61 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  42.48 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  40.65 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  42.31 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  35.29 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  37.08 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  43.66 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  38.29 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  46.95 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  46.95 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  35.78 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  40.28 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  36.1 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  38.39 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  38.25 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  33.19 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  35.5 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  33.64 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  33.64 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  37.22 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.43 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  37.14 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.48 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  38.86 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  31.37 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  31.6 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.78 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  33.18 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30.88 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.18 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  33.65 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.6 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  31.63 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  29.71 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  27.59 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  32.18 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  30.35 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  31.68 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  31.19 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  31.19 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  31.19 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  31.68 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  38.51 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  31.63 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  31.19 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  30.69 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.49 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  27.04 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  31.09 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.34 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  27.49 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  31.16 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  28.08 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.4 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  31.28 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  29.67 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  27.92 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  31.21 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  31.49 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  36.05 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  30.21 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.32 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  28.16 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  31.43 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  29.25 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  27.94 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  27.83 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  29.49 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28.69 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  29.19 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  27.23 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  32.7 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  28.8 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>