163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2967 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  43.15 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  37.34 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.58 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  38.39 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  37.56 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  37.16 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  35 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  33.91 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  34.82 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.72 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  34.72 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  33.61 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  35.16 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  33.61 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  33.94 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  34.91 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  39.15 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  33.65 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  33.65 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  32.86 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  35.85 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  36.62 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  30.63 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  33.18 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.24 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  35.07 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.84 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  34.76 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  32.69 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  33.02 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.5 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  30.65 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.24 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  32.42 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  31.46 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  34.7 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  34.7 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  33.18 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.51 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.05 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  29.47 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  31.51 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.28 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.34 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  27.83 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  30.37 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  25.54 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  31.78 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  30.58 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  30.58 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  30.58 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.54 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  24.46 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  30.12 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  24.46 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.1 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  29.58 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  23.91 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  32.24 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  31.96 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30.54 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  24.46 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  25.83 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.8 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  30.7 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.58 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25.58 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  32.41 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  28.64 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  27.03 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  30.33 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.67 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.12 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  24.9 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  33.5 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>