168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1293 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  100 
 
 
251 aa  493  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  58.96 
 
 
247 aa  297  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  38.46 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.54 
 
 
242 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  36.19 
 
 
245 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  35.62 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  32.93 
 
 
236 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  34.35 
 
 
258 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  32.54 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  34.7 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  35.71 
 
 
239 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  37.8 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  32.94 
 
 
251 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  34.21 
 
 
236 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  29.27 
 
 
244 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.8 
 
 
250 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  30.74 
 
 
251 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  33.97 
 
 
245 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  32.2 
 
 
247 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  34.41 
 
 
243 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  30.13 
 
 
249 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.63 
 
 
245 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  32.86 
 
 
234 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  30.57 
 
 
235 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  34.13 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  33.17 
 
 
237 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  31.86 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  32.11 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.74 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  32.41 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.96 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  30.43 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  31.62 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  30.71 
 
 
242 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  32.55 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  33.17 
 
 
241 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  31.6 
 
 
281 aa  92  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  92  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  30.92 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  28.74 
 
 
242 aa  92  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.17 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  31.28 
 
 
240 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30.91 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  29.61 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  29.46 
 
 
239 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.95 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  31.43 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.79 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  24.61 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  29.81 
 
 
236 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  29.81 
 
 
236 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  29.81 
 
 
236 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  27.42 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  28.15 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  28.15 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  28.15 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  30.95 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.31 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  28.38 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  27.01 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00770  hypothetical protein  30.49 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.5 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  33.12 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.94 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  30.23 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  31.87 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  26.44 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  26.32 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  26.19 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  29.59 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  25.84 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  28.36 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.09 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  25.48 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  26.16 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  32.41 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  26.12 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  28.72 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.88 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  32.32 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.88 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  23.66 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  29.95 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.74 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  30.52 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  29.28 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.78 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>