95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0141 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  77.16 
 
 		 250 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  34.18 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  34.18 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  34.18 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  33.67 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  33.16 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  34.35 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  94.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  32.83 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  31.28 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  32.96 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  32.4 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  32.4 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  32.96 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  32.4 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  32.81 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  32.58 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  33.51 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  30.17 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  30.17 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  30.17 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  30.73 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  32.04 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  32.58 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  29.9 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  32.64 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  28.18 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  33.1 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  26.28 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  29.15 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  29.55 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  26.06 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  26.53 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.15 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  24.82 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.45 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  27.2 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.64 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  26.85 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  24.26 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.45 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24.31 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  23.14 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  24.87 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  27.64 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  25.22 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  25.19 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  23.49 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.79 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  22.28 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  23.81 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.36 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  25.78 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  22.86 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.41 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  26.45 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  22.6 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  23.73 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  22.6 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  21 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  25.81 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3721  protein of unknown function DUF541  23.02 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.914927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  22.22 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01998  putative periplasmic immunogenic protein  25 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0383413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  21.37 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  24.62 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  26.81 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  21.48 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  23.32 
 
 		 256 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  25.69 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  25.69 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  25.69 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>