52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0417 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0417  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3934  protein of unknown function DUF541  45.28 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0407  protein of unknown function DUF541  45.64 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0037084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3582  hypothetical protein  38.82 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0237559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.16 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  29.21 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.34 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.1 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25.1 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  24.53 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  28.4 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  23.11 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  24.7 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.4 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  26.45 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  24.66 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  23.84 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.71 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  24.84 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  26.02 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  23.38 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  25.23 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3812  protein of unknown function DUF541  29.61 
 
 		 352 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  23.35 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.37 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  23.91 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  23.91 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  23.91 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  23.94 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  25.31 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  26.36 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  23.29 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3814  protein of unknown function DUF541  30.92 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  21.79 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  24.82 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  20.55 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  20.55 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  20.55 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  23.05 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  25.1 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  22.94 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  24.52 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  21.11 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  22.71 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  24.62 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  20.81 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  24.39 
 
 		 237 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  22.71 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  22.71 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  22.71 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>