14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3814 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3814  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
356 aa  713    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3812  protein of unknown function DUF541  78.37 
 
 
352 aa  548  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3813  protein of unknown function DUF541  27.39 
 
 
355 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0296  hypothetical protein  26.88 
 
 
663 aa  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4119  protein of unknown function DUF541  25.93 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  29.85 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  29.37 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.44 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  23.12 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0417  protein of unknown function DUF541  30.92 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  25.67 
 
 
259 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  27.14 
 
 
243 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  26.89 
 
 
242 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  26.89 
 
 
242 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>